เมื่อ ซากาตะ กินโทกิ ถูกจับยัดบท “คุณครูห้อง 3-Z” โรงเรียนกินทามะ—ห้องที่รวมเด็กป่วนระดับตำนานเอาไว้ครบ (พวกชินปาจิ, คางุระ, ชินเซ็นกุมิ ฯลฯ) ชีวิตโรงเรียนสุดวายป่วงและมุกเมต้าเบรกกำแพงที่สี่จึงเริ่มขึ้น ครูซ่ากับลูกศิษย์ตัวป่วนต้องรอดทั้งคาบเรียน ทัศนศึกษา งานวัฒนธรรม…และบทลงโทษสุดเพี้ยนที่ไม่มีในหนังสือเรียน