เล่าเรื่องราวในยุคบาคุมัตสึ (ปลายยุคซามูไร) ที่เมืองเอโดะ เมื่อเด็กหนุ่มผู้ใช้เด็ค Standard ได้พบกับซามูไรลึกลับผู้ใช้เด็ค Eternal และร่วมกันเดินทางเพื่อสร้างเรื่องราวการต่อสู้ครั้งใหม่