โนบิตะขอร้องให้โดราเอมอนยืมกล่องโมชิโมะให้เขา โดยหวังว่าโลกที่เวทมนตร์ไม่ใช่แค่มีจริงเท่านั้น แต่ยังเป็นเรื่องธรรมดาอีกด้วย ในโลกใหม่นี้ เวทมนตร์ได้เข้ามาแทนที่วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี โดยทุกคนนำมันมารวมไว้ในกิจวัตรประจำวันของพวกเขา น่าเสียดายที่โนบิตะต้องดิ้นรนกับการแสดงคาถา ทำให้เขารู้สึกท้อแท้ เขาตัดสินใจที่จะคืนทุกสิ่งทุกอย่างให้กลับสู่สภาพเดิม แต่แผนการของเขาต้องพังทลายลงเมื่อแม่ของเขาโยนกล่องโมชิโมะทิ้งโดยไม่ตั้งใจ

ในวันหนึ่งแห่งชะตากรรม โดราเอมอนและสหายของเขามีความยินดีที่ได้พบกับศาสตราจารย์มังเก็ตสึ ผู้เชี่ยวชาญด้านเวทมนตร์และเวทมนตร์ศาสตร์ รวมถึงการศึกษาสิ่งมีชีวิตลึกลับ เช่น ก็อบลินและมิโยโกะ ซึ่งเป็นลูกหลานของเขา ก่อนหน้านี้ศาสตราจารย์เคยได้รับคำเตือนเกี่ยวกับ "ดวงดาวแห่งยมโลก" ที่เป็นลางร้ายซึ่งโคจรรอบโลก และอันตรายที่อาจเกิดขึ้น

ชะตากรรมของโลกของเราแขวนอยู่บนความสมดุล เพื่อปกป้องมัน พวกเขาจึงเริ่มต้นการเดินทางที่ทรยศไปยังยมโลก โดยติดอาวุธด้วยลูกดอกสีเงินเพื่อแทงทะลุหัวใจของราชาแห่งยมโลก ตามเรื่องราวใน "The Chronicles of the Underworld" ภารกิจของพวกเขาพบกับความยากลำบาก ส่งผลให้มีการจับกุมมิโยโกะ

โดราเอมอนและเพื่อนๆ เลือกใช้ไทม์แมชชีนเพื่อเดินทางสู่อดีตและใช้กล่องโมชิโมะของโดรามิ การกระทำของพวกเขาแก้ไขสถานะของโลกได้สำเร็จ อย่างไรก็ตาม ในจักรวาลสำรอง เหตุการณ์ใน Underworld ยังคงมีอยู่ โดยที่มิโยโกะยังคงถูกคุมขัง การพัฒนานี้บังคับให้กลุ่มต้องเริ่มต้นการเดินทางอีกครั้งไปยังยมโลก โดยมีวัตถุประสงค์เพื่อปราบผู้นำเผด็จการอย่างถาวร