เมื่อตอนเป็นเด็ก Taiju วางแผนที่จะสารภาพความรู้สึกของเขากับ Yuzuriha ที่เขาแอบชอบ ทันใดนั้นมนุษยชาติก็ต้องเผชิญกับปรากฏการณ์ประหลาดที่ทำให้ทุกคนกลายเป็นหินในทันที หลังจากถูกขังอยู่ในคุกหินมานานกว่าสามพันปี ในที่สุด Taiju ก็ปรากฏตัวขึ้นในปีคริสตศักราช 5738 เมื่อกลับมาพบกับ Senku เพื่อนเก่าของเขา ซึ่งเป็นเด็กอัจฉริยะที่เก่งกาจและหลงใหลในวิทยาศาสตร์อย่างลึกซึ้ง ทั้งสองทำงานร่วมกันเพื่อชุบชีวิตบุคคลที่กลายเป็นหินคนอื่นๆ โดยใช้ความรู้อันกว้างขวางและเทคโนโลยีที่เป็นนวัตกรรมของ Senku จากอดีต ด้วยความช่วยเหลือจากความเชี่ยวชาญของ Senku และความมุ่งมั่นอันแน่วแน่ของ Taiju พวกเขามุ่งมั่นที่จะสร้างอารยธรรมมนุษย์ที่หลงเหลืออยู่ซึ่งโผล่ออกมาจากยุคหินขึ้นใหม่