ในงานที่เรียกว่า "ไทจู" นักเรียนมัธยมปลายตั้งใจที่จะสารภาพรักกับเพื่อนร่วมชั้นที่เขาเก็บงำความรู้สึกไว้เป็นความลับมาเป็นเวลานาน ทันใดนั้น แสงประหลาดก็เล็ดลอดออกมา ทำให้ผู้คนทั่วโลกกลายเป็นหินในเวลาไม่กี่วินาที Taiju ยังคงอยู่ในสถานะกลายเป็นหิน ความหวังและความฝันของเขาถูกแช่แข็งในเวลาหลายพันปี ในที่สุด ก้อนหินที่ห่อหุ้มเขาไว้ก็แตกกระจาย เผยให้เห็นข้อความที่กระตุ้นให้เขาเดินไปตามเส้นทางที่แน่นอน Taiju เดินตามเส้นทางไปอย่างซื่อสัตย์และได้พบกับ Senku เพื่อนร่วมชั้นของเขาที่ตื่นขึ้นมาเมื่อหกเดือนก่อน Taiju และ Senku ร่วมมือกันเพื่อสร้างอารยธรรมของมนุษย์ขึ้นมาใหม่ตั้งแต่ต้น