Taiju Oki นักเรียนมัธยมปลายเก็บความรู้สึกที่มีต่อ Yuzuri Haokawa ไว้กับตัวเองเป็นเวลาห้าปี อย่างไรก็ตาม ตอนนี้เขามาถึงจุดที่เขาพร้อมที่จะสารภาพรักแล้ว เหตุการณ์ที่เกิดขึ้นภายหลังคำสารภาพของเขานั้นลึกซึ้งมากจนทำให้มนุษย์ทุกคนบนโลกกลายเป็นหิน ส่งผลให้มนุษยชาติตกตะลึง

หลังจากผ่านไปหลายพันปี Taiju ตื่นขึ้นจากการหลับใหลและค้นพบว่าโลกสมัยใหม่ได้สูญสลายไปแล้ว เปิดทางให้ธรรมชาติที่เจริญรุ่งเรืองในขณะที่มนุษยชาติหยุดนิ่ง ท่ามกลางภูมิทัศน์ของรูปปั้น Taiju มีโอกาสได้พบกับ Zen ซึ่งเป็นมนุษย์เพียงคนเดียวที่รอดชีวิต จากนั้น Taiju ก็กลับมารวมตัวกับเพื่อนของเขา Koo ผู้รักวิทยาศาสตร์และกระตือรือร้นมาสองสามเดือนแล้ว มีการเปิดเผยว่า Senkuu ซึ่งเป็นเพื่อนผู้รอดชีวิตได้คิดค้นแผนการอันยิ่งใหญ่เพื่อฟื้นฟูอารยธรรมด้วยวิธีการทางวิทยาศาสตร์ การผสมผสานระหว่างความแข็งแกร่งของ Taiju และสติปัญญาของ Senku ทำให้เกิดความร่วมมือที่แข็งแกร่ง และในไม่ช้าพวกเขาก็ค้นพบวิธีการในการเปลี่ยนผู้ที่กลายเป็นหินให้กลับกลายเป็นร่างมนุษย์

แผนการอันยิ่งใหญ่ของ Senkuu เผชิญกับความท้าทายอย่างต่อเนื่องจากผู้ที่ฟื้นคืนชีพเขา ซึ่งทำให้อุดมการณ์ของเขาตกอยู่ในความเสี่ยง เหตุผลเบื้องหลังการทำให้มนุษยชาติกลายเป็นหินยังคงถูกปกคลุมไปด้วยความลึกลับ