หลังจากครอบครอง Edens Zero และรวบรวมดาวได้สี่ดวงแล้ว Shiki Granbell ก็ได้ทีมสหายที่น่าเกรงขาม ด้วยความช่วยเหลือของพวกเขา เขาตั้งใจที่จะแทรกซึมเข้าไปใน Dragonfall - ภูมิภาคของ Sakura Cosmos ที่เต็มไปด้วยมังกรจักรกล หลังจากทำภารกิจนี้สำเร็จ ชิกิจะสามารถค้นหาแม่เทพธิดาต่อไปได้

ภารกิจของลูกเรือ Edens Zero ถูกขัดจังหวะด้วยรูปลักษณ์ที่ไม่คาดคิดของเรือรบลึกลับที่ติดตามพวกเขา เมื่อพบว่ามันคือบีเลียลกอร์ ซึ่งเป็นเรือของแดร็กเคน โจผู้โด่งดัง ชิกิและทีมงานจึงออกเดินทางเพื่อตรวจสอบจุดประสงค์ของมัน วัตถุประสงค์ของพวกเขาคือการเปิดเผยเหตุผลว่าทำไม Dark Alchemist ผู้ลึกลับจึงไล่ตามพวกเขาอย่างไม่ลดละ อย่างไรก็ตาม ในระหว่างการแทรกซึมของเรือ ลูกน้องของ Drakken สามารถจับ Edens Zero และจับพวกเขาเป็นตัวประกันได้

แม้จะมีสถานการณ์ที่ท้าทาย แต่ชิกิก็ปฏิเสธที่จะยอมแพ้ ความมุ่งมั่นของเขายังคงไม่สั่นคลอนแม้ในขณะที่เขาร่วมมือกับเพื่อนๆ ของเขา โดยรู้ว่าหนทางเดียวที่จะเอาชีวิตรอดจากบีเลียลกอร์ได้คือการเอาชนะ Dark Alchemist