เมลและผู้ติดตามของเขา มัล ซึ่งเป็นทายาทแห่งบัลลังก์แห่งดาวเคราะห์มารอน ได้ออกจากดาวเคราะห์บ้านเกิดของพวกเขาแล้ว พวกเขามาถึงดาวดวงหนึ่งที่ไม่มีแผ่นดินแต่มีน้ำให้พวกมันว่ายน้ำเข้าไป วัตถุประสงค์ของพวกเขาคือบุกโลกมนุษย์และค้นหาเจ้าหญิงเพื่อสร้างโลกของตัวเอง อย่างไรก็ตาม แผนการของพวกเขาหยุดชะงักกะทันหันเมื่อพวกเขาอุทานว่า "พระเจ้าช่วยฉันด้วย กล้วยทอด!" เจ้าหญิงที่พวกเขาตามหานั้นมีคุณสมบัติเฉพาะเจาะจง และพวกเขาก็ได้พบเธอในนัตสึมิ เด็กสาวที่ทรงพลังที่สุดที่อาศัยอยู่ในบ้านของกองกำลังเคโรโระ
นัตสึมิถูกมนุษย์ต่างดาวสองคนลักพาตัวและถูกนำตัวไปยังอาณาจักรใต้น้ำอันลึกลับ เหตุการณ์นี้ทำให้กองกำลังเคโรโระใช้กำลังอย่างเต็มที่ในสงครามอันยิ่งใหญ่เพื่อยึดคืนนัตสึมิ อย่างไรก็ตาม นัตสึมิได้รับการต้อนรับอย่างอบอุ่นในฐานะเจ้าหญิง และเธอก็พอใจกับสถานะผู้สูงศักดิ์ที่เพิ่งค้นพบ แม้ว่าจะไม่กลัว แต่เธอก็แอบเพลิดเพลินกับประสบการณ์นี้ เคโรรอสจะสามารถดึงนัตสึมิกลับมาได้หรือไม่? และพวกเขาจะสามารถปกป้องโลกมนุษย์จากเงื้อมมือของมนุษย์ต่างดาวได้หรือไม่? ผลของผลลัพธ์สุดท้ายยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด