ในเรื่องนี้ โคบาโตะถูกบรรยายเป็นเด็กสาวที่มีกลิ่นอายแห่งความลึกลับล้อมรอบตัวเธอ อย่างไรก็ตาม เธอมีความอ่อนโยนและมีทัศนคติเชิงบวกต่อชีวิต หน้าที่ของเธอคือรักษาบาดแผลที่กระทบใจผู้คน โดยเธอต้องเติมสารที่เรียกว่า "คอมเปโต" ลงในขวด เมื่อเต็มขวดแล้วเธอก็สามารถไปยังจุดหมายปลายทางที่ต้องการได้ ตลอดภารกิจของเธอ เธอมาพร้อมกับพี่เลี้ยงเด็กในรูปของตุ๊กตาสุนัขสีน้ำเงินชื่ออิโอโยกิซัง ซึ่งเป็นตัวแทนของพ่อ แม้ว่าเขาจะดูน่ารักและเป็นที่รัก แต่เขากลับเข้มงวดและโหดร้ายต่อโคบาโตะอย่างไม่น่าเชื่อ