หลังจากการล่มสลายของ Eunius Seven ตามเนื้อเรื่องหลักใน Gundam Seed Destiny กองกำลังทหารทั่วโลกได้ระดมกำลังเพื่อเสนอความช่วยเหลือแก่ภูมิภาคที่ได้รับผลกระทบ ในขณะเดียวกัน Selene McGriff พนักงานของ DSSD (องค์การสำรวจและพัฒนาห้วงอวกาศ) ได้พยายามหาทางกลับไปยังสถานีอวกาศของ DSSD เพื่อทำการทดลองกับชุดเคลื่อนที่รุ่น 401 ซึ่งต่อมาได้รับการตั้งชื่อว่า "Stargazer (GSX-401FW Stargazer)" เพื่อวัตถุประสงค์ในการสำรวจอวกาศ