เคนอิจิ มิตสึบะ เด็กชายอายุ 11 ปี เข้าเรียนมัธยมปลาย แต่มีปัญหากับการเรียน และมักจะดื้อรั้นและเกียจคร้าน เป็นผลให้เขาหงุดหงิดกับทั้งพ่อแม่และครู อย่างไรก็ตาม เขาได้เพื่อนที่เป็นนินจาตัวเล็กชื่อ ฮัตโตริ คันโซ ซึ่งกลายเป็นส่วนหนึ่งของครอบครัวของเคนจิพร้อมกับชินโซน้องชายของเขา และชิชิมารุ สุนัขนินจาของเขา ฮัตโตริช่วยเคนจิแก้ปัญหาและคอยจับตาดูเขาในฐานะเพื่อนที่ดี ยูเมโกะเป็นคนรักของเคนอิจิ และเขายังต้องจัดการกับเคมูมากิ นินจาโคงะ แมวนินจาของเขา และคาเงคิโยะที่มักจะมีปัญหากับเขา เมื่อเคนอิจิขอให้ฮัตโตริแก้แค้น บางครั้งมิตรภาพของพวกเขาก็ถูกทดสอบเนื่องจากความเข้าใจผิดที่เคมูมากิสร้างขึ้น จิปโป โทเกจิโระ และสึบาเมะก็ยื่นมือช่วยเหลือเคนอิจิเช่นกัน