เรื่องราวของ Owari no Seraph บรรยายถึงโลกที่มีไวรัสลึกลับติดเชื้อและทำให้มนุษย์ทุกคนที่มีอายุเกิน 13 ปีเสียชีวิต เด็กที่รอดชีวิตกลายเป็นนักโทษของแวมไพร์ผู้เป็นเจ้าเหนือหัวของพวกเขา ซึ่งได้ยึดครองโลกและใช้มนุษย์เป็นทั้งอาหารและผู้ใต้บังคับบัญชา Hyakuya Yuichiro เป็นเด็กหนุ่มที่ถูกส่งไปยังสถานเลี้ยงเด็กกำพร้าเพื่อเป็นแหล่งอาหารของแวมไพร์ เขามีความฝันที่จะกำจัดแวมไพร์ให้หมดไปจากโลกและลุกขึ้นมาต่อสู้กับพวกมัน