ในระหว่างการเดินทาง Satoshi และสหายของเขาได้แวะที่ Crown City เพื่อชม Pokémon Backer World Cup และทัวร์ชมเมือง ขณะเที่ยวชมสถานที่ พวกเขาได้พบกับโปเกมอนชื่อโซรัวที่กำลังค้นหาสหายของมันเอง การตัดสินใจให้ความช่วยเหลือในการค้นหา Satoshi และเพื่อนๆ ของเขายินดีต้อนรับ Zoroa ให้เข้าร่วมกับพวกเขา อย่างไรก็ตาม สิ่งต่างๆ กลับแย่ลงเมื่อ Zoroark ผู้ควบคุมภาพลวงตา ปรากฏตัวและแปลงร่างเป็น Raikou, Ente และ Suikun ก่อให้เกิดการทำลายล้างทั่ว Crown City หลังจากผ่านไปสองทศวรรษ Celebi ก็กลับมาที่ Crown City และพัวพันกับความลึกลับที่เกี่ยวข้องกับชะตากรรมของเมือง Satoshi และ Pikachu จะสามารถช่วยเมืองและผู้อยู่อาศัยจากการล่มสลายของ Zoroark ได้หรือไม่? แล้วเซเลบีจะมีบทบาทอย่างไรในสถานการณ์อันตรายนี้?