ที่โรงเรียนนางฟ้า ซึ่งเป็นโรงเรียนอันห่างไกล ทาร์ตบรรยายเกี่ยวกับพริตตี้เคียว นางฟ้าตัวน้อยสองคน คุเรรุ และ เอ็นเอ็น จอมซนและขี้อาย ตามลำดับ ผจญภัยไปยังต้นไม้ต้องห้าม คุเรรุรู้สึกทึ่งกับการเอ่ยถึงสาวสวยชื่อพริตตี้เคียว เป็นผู้นำ เป้าหมายของพวกเขาคือการได้รับไอเทมแปลงร่างของ Pretty Cure จาก Gureru โดยหวังว่าจะได้รับชื่อเสียง หลังจากนั้นไม่นาน คำเชิญจะถูกส่งไปยังกลุ่มพริตตี้เคียวทั้งหมด โดยเชิญพวกเขาให้เข้าร่วมงานปาร์ตี้ที่ Little Fairy Academy ในขณะเดียวกัน Mana, Rikka, Alice และ Makoto ได้รับจดหมายจาก Miyuki และ Candy แจ้งให้พวกเขาทราบเกี่ยวกับงานปาร์ตี้และกระตุ้นให้พวกเขาเข้าร่วม ในขณะเดียวกันที่ Little Fairy Academy เงาของ Gureru บังคับให้ Gureru จับผีตัวน้อยและไอเทมแปลงร่างของ Pretty Cure ทำให้เธอเสี่ยงต่อการถูกโจมตี หลังจากเอาชนะพริตตี้เคียวในครั้งนี้ เงาของกูเรรุจะเปลี่ยนโฟกัสไปอยู่ที่อื่น สไมล์พรีเคียว!
ด้วยการใช้หนังสือแนะนำ Pretty Cure เป็นเครื่องมือเชิงกลยุทธ์ พวกเขาตอบโต้ทุกการเคลื่อนไหวที่กระทำต่อพวกเขา โดยยึดชุดรอยยิ้มของพวกเขาอย่างมีไหวพริบ และต่อมาก็ขังพวกเขาไว้ในรูปปั้นเหมือนกับคนอื่นๆ ทั้งหมด เอ็น-เอ็นอยู่ในสภาพลำบากใจขอความช่วยเหลือจากชาโดว์คุเรรุ ซึ่งมิยูกิให้ความมั่นใจแก่เขาและแนะนำให้เขาขอความช่วยเหลือจากโดกิโดกิ! พรีเคียว. หลังจากนั้นไม่นาน มิยูกิก็พบว่าตัวเองถูกกลืนหายไปก่อนที่เธอจะพบวิธีแก้ปัญหาเพื่อกำจัดเงาของกูเรรุ เชื่อกันอย่างกว้างขวางว่า Pretty Cure จะค้นพบหนทางที่จะปราบเงาของ Gureru ได้ ด้วยความประหลาดใจของ Gureru เงาจึงได้เปิดเผยวาระที่แท้จริงในการทำลายล้างสถาบันและกักขังนักเรียนเพียงไม่กี่คนที่ยังไม่อยู่ภายใต้การควบคุมของมัน Gureru และ En-en เริ่มต้นภารกิจเพื่อค้นหา Dokidoki! พรีเคียวและวิงวอนให้พวกเขาช่วยในภารกิจหยุดยั้งเงาของกูเรรุ ในขณะเดียวกัน Pretty Cure ได้ต่อสู้อย่างกล้าหาญกับสมุนแห่งเงาของ Gureru โดยได้รับความช่วยเหลือจาก Candy และ Pop ด้วยความพยายามร่วมกันของพวกเขา พวกเขาจึงสามารถค้นหานางฟ้าที่ถูกกักขังได้ และด้วยความช่วยเหลือจากเพื่อนนักเรียนนางฟ้าที่ถือแสงแห่งปาฏิหาริย์ ก็สามารถดึงไอเทมแปลงร่างที่ถูกขโมยไปได้สำเร็จ
ด้วยความช่วยเหลือของ Little Ghosts ช่วยในการตื่นขึ้นใหม่และแสงสว่างของอาณาจักรที่อาศัยอยู่โดย Little Ghosts แต่ละทีมของ Pretty Cure ลุกขึ้นอย่างกล้าหาญเพื่อต่อสู้กับความมืดที่ Gureru สร้างขึ้นเพื่อขอความช่วยเหลือครั้งสุดท้าย ด้วยพลังสูงสุดของเขา Gureru ได้กลายร่างเป็นแมงมุมขนาดมหึมา แต่สุดท้ายก็พ่ายแพ้ พริตตี้เคียวได้ทำให้คุเรรุซึ่งเดิมเคยเป็นเงาหรือแมงมุมยักษ์กลับคืนสู่สภาพเดิม โดยได้รับคำขอโทษจากทั้งคุเรรุและเงาของเธอ รวมถึงเอ็นเอ็น ต่อพริตตี้เคียวและนางฟ้าตัวน้อยทั้งหมด ส่งผลให้พวกมันกลายร่างเป็นนางฟ้า เมื่อความสงบกลับคืนสู่โลกของ Little Fairies และ Little Fairy Academy แล้ว Pretty Cure ก็ได้รับความช่วยเหลือในการฟื้นฟูสถาบัน ก่อนที่จะเฉลิมฉลองความสำเร็จของพวกเขาด้วยการเฉลิมฉลองครั้งยิ่งใหญ่