Kijima Naito เป็นเด็กที่ครอบครองพลัง Sacred Seven และถูกส่งไปยัง Kenmi Experimental Facility ซึ่งเป็นสถาบันวิจัยที่เจาะลึกธรรมชาติของพลังนี้ สถานที่นี้อยู่ภายใต้การดูแลของเคนมิ ยูจิ และเป็นบ้านของเด็กๆ จำนวนมากที่แสดงพลังศักดิ์สิทธิ์ทั้งเจ็ดด้วย ในระหว่างที่เขาอยู่ที่นี่ เขาได้พบกับ Faye และ Hong Yu ซึ่งเป็นพี่น้องที่เขาเป็นเพื่อนกัน จนกระทั่ง Hong Yu ประสบการทดลองที่เปลี่ยนเขาให้เป็นมนุษย์ Dark Stone ไนโตะปลุกพลังเซเว่นศักดิ์สิทธิ์ของเขาและหนีออกจากสถานที่พร้อมกับเฟย์ ระหว่างทางพวกเขาได้พบกับทันโดจิ อารุมะ อีกคนที่มีพลังศักดิ์สิทธิ์ทั้งเจ็ด และการเดินทางของพวกเขาก็เริ่มต้นขึ้น เรื่องราวเจาะลึกความลึกลับที่อยู่รอบ Sacred Seven แรงจูงใจของ Kenmi และเหตุการณ์โศกนาฏกรรมที่เกิดขึ้นภายในสถานที่ทดลอง ซึ่งทั้งหมดนี้จะถูกเปิดเผยในไม่ช้า