เมื่อแทรกซึมเข้าไปในจักรวรรดิที่เพิ่งก่อตั้ง กลุ่มร่างโคลนพิเศษที่รู้จักกันในชื่อ "The Bad Batch" ก็มาถึง หน่วยนี้ประกอบด้วยร่างโคลนที่มีความสามารถพิเศษและผลข้างเคียงที่ดี ภารกิจของพวกเขาคือการค้นหาว่าเหตุใดทหารโคลนทั้งหมดจึงหันมาต่อต้านนายพลเจได