ในความพยายามอันกล้าหาญของพวกเขาที่จะขัดขวางแผนการชั่วร้ายของ Fusion ซึ่งเป็นองค์กรชั่วร้ายที่พยายามจะห่อหุ้มโลกไว้ในความมืดมิด สาวๆ Pretty Cure ได้รวมตัวกันและแยก Fusion ออกเป็นชิ้นๆ ได้สำเร็จ โดยที่พวกเขาไม่รู้ เด็กสาวชื่อ อายูมิ ซาคากามิ ซึ่งเพิ่งย้ายมาจากเมืองอื่น บังเอิญไปพบกับแก่นแท้ของฟิวชั่น โดยเข้าใจผิดคิดว่าเป็นชื่อของตัวเองและตั้งชื่อให้เหมือนกัน อายูมิพร้อมด้วยสหายใหม่ของเธอ ฟุอุจัง ฮิบิกิ และมิยูกิ ได้พบกับฮามิและแคนดี้ซึ่งเปิดเผยตัวตนที่แท้จริงของพวกเขาในชื่อพริตตี้เคียวหลังจากการจากไปของอายูมิ ตามที่โชคชะตากำหนด Fusion ก็ปรากฏตัวขึ้นอีกครั้ง ส่งผลให้ทั้งสองคู่ต้องออกตามหา คานาเดะ เอลเลน และอาโกะเข้าร่วมการไล่ล่าและร่วมกันแปลงร่างเป็นเคียวเมโลดี้ เคียวริธึม เคียวบีท และเคียวมิวส์ ตามลำดับ โดยสมมติว่าร่างที่มิยูกิครอบครองนั้นเอง รวมกันเป็นห้า Cure Happy พวกเขาเอาชนะ Fusion ได้อีกครั้งอย่างมีชัย ในเหตุการณ์พลิกผันในเวลาต่อมา อายูมิพบว่าตัวเองพัวพันกับความขัดแย้งกับแม่ของเธอ ทำให้เธอต้องหนีออกจากบ้านและมาพบกับมิยูกิและเพื่อนๆ ของเธอ การไม่มีเพื่อนของอายูมิทำให้เธอเสียใจอย่างสุดซึ้ง ทำให้ฟุอุจังโกรธแค้นมิยูกิ ด้วยความรู้สึกสิ้นหวัง อายูมิจึงโจมตีและโจมตีมิยูกิ
กลุ่มบุคคลทั้งห้าได้รับการเปลี่ยนแปลง และกลายเป็นนักรบผู้ทรงพลังที่รู้จักกันในชื่อพริตตี้เคียว ภารกิจของพวกเขาคือการเผชิญหน้าและต่อสู้กับ Fuu-chan แต่ในตอนแรก ความพยายามของพวกเขาพิสูจน์แล้วว่าไร้ประโยชน์ อย่างไรก็ตาม Sweet Precure♪ ก็เข้ามาช่วย แต่อายูมิกลับขัดขวางความพยายามของพวกเขาโดยไม่เต็มใจที่จะให้พวกเขาช่วย ความภักดีของอายูมิที่มีต่อฟุจังทำให้การตัดสินใจของเธอคลุมเครือ ทำให้เธอไม่ตระหนักถึงอันตรายที่ฟูจังก่อขึ้น แม้ว่าเคียวมิวจะพยายามอธิบายสถานการณ์ แต่อายูมิก็ยังคงดื้อรั้นและปกป้องเพื่อนของเธอ และในที่สุดก็หนีออกจากที่เกิดเหตุได้ ในสายตาของอายูมิ เธอกลายเป็นศัตรูของพริตตี้เคียว เมื่อกลับถึงบ้าน อายูมิต้องเผชิญกับคำตำหนิจากแม่ของเธอ เมื่อเห็นเหตุการณ์นี้ ฟูจังจึงใช้พลังของเธอทำให้แม่ของอายูมิหายตัวไป ปล่อยให้อายูมิสับสนและสับสน ฟูจังได้ขึ้นไปถึงจุดสูงสุดเพื่อที่จะกลับมารวมตัวกับชิ้นส่วนอื่นๆ อายูมิตั้งใจจะตามเธอไปพบกับสไมล์พรีเคียว! ทีมและขอความช่วยเหลือในการเข้าถึง Fuu-chan ในช่วงเวลานี้ อายูมิยังได้พบกับ HeartCatch PreCure! และเฟรชพรีเคียว! กลุ่มที่เมื่อแปลงร่างเป็นพริตตี้เคียวแล้วจึงร่วมมือกันเพื่อให้ความช่วยเหลือ ต่อมา Miraculous Pretty Cure Max Heart, Miraculous Pretty Cure Splash☆Star และ Yes! พรีเคียว 5 โกโก! ทีมงานก็มาให้การสนับสนุนด้วย
อายูมิจวนจะถูกกลืนกินโดยเอนทิตีฟิวชั่น แม้ว่าจะมีสามกลุ่มเข้ามาช่วยเหลือเธอก็ตาม ท่ามกลางอันตรายนี้ อายูมิครุ่นคิดถึงวิธีที่เธอจะแสดงอารมณ์ต่อฟูจังได้อย่างไร แต่จู่ๆ เหตุการณ์อัศจรรย์ก็เกิดขึ้น อายูมิได้รับการเปลี่ยนแปลงกลายเป็น "เคียวเอคโค่" โดยได้รับการสนับสนุนจากเหล่านางฟ้าจากพริตตี้เคียว ด้วยพลังของ "แสงมหัศจรรย์" เคียวเอคโค่จึงขึ้นไปหาฟุจังและถ่ายทอดความรู้สึกจากใจของเธอ เมื่อฟูจังได้ยินดังนั้น จึงสั่งให้ชิ้นส่วนอื่นๆ หยุดการโจมตี แต่พวกมันก็ยังคงโจมตีต่อไป อายูมิเข้าใจว่าสไมล์พรีเคียว! คนเดียวจะไม่สามารถอดทนได้อีกต่อไป ดังนั้นเธอจึงตัดสินใจอย่างไม่เห็นแก่ตัวที่จะกลายเป็นแหล่งความเข้มแข็งสำหรับพวกเขา กำลังใจจากเหล่านางฟ้า สไมล์ พรีเคียว! เผชิญหน้ากับเอนทิตีฟิวชั่นอย่างกล้าหาญ และนำความสงบสุขมาสู่โลกอีกครั้งในท้ายที่สุด