Toaru Kagaku no Railgun เป็นภาคต่อของอนิเมะที่มีเรื่องราวคู่ขนาน เรื่องราวมุ่งเน้นไปที่ Misa และ Mikoto โดยมี Touma ปรากฏตัวเป็นครั้งคราว ติดตามชีวิตประจำวันของ Misaka และวิ่งขนานกับส่วนโค้งดัชนีใน Toaru Kagaku no Railgun มิซากะและกลุ่มเพื่อนของเธอรวมตัวกันเพื่อสืบสวนปรากฏการณ์เหนือธรรมชาติที่เรียกว่าเลเวลอัปเปอร์ ซึ่งมีพลังในการขยายความสามารถทางจิต