ในช่วงหลังของเดือนกรกฎาคม ปี 2010 โอคาเบะ รินทาโร ซึ่งเป็นนักวิทยาศาสตร์สติเฟื่องที่ประกาศตัวเองว่าบ้าคลั่ง พบว่าตัวเองตกอยู่ในสถานการณ์ที่เขาบังเอิญเจอมากิเสะ คุริสุนอนจมกองเลือด ในช่วงเวลานี้ เขาส่งอีเมลผิดพลาด ซึ่งทำให้เขาต้องเปลี่ยนไปใช้ Alpha World Line ในโลกนี้ เขาได้พบกับคุริสุที่ยังมีชีวิตอยู่แต่ได้ผ่านเหตุการณ์ที่แตกต่างจากเมื่อก่อน ในโลกนี้ โอคาเบะและกลุ่มของเขาสามารถสร้าง "โทรศัพท์ไมโครเวฟ" และ "เครื่องกระโดด" ซึ่งช่วยให้พวกเขาย้อนเวลากลับไปและเปลี่ยนแปลงอดีตได้ อย่างไรก็ตาม นี่ไม่ใช่การปราศจากความเสี่ยง เนื่องจาก SERN ซึ่งเป็นองค์กรที่ทำการทดลองและรวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับวิทยาศาสตร์ที่เกี่ยวข้องกับไทม์แมชชีน กำลังวางแผนที่จะครองโลกด้วยการควบคุมเวลา ผลก็คือ SERN บุกห้องทดลองของ Okabe โอคาเบะจึงใช้ Leap Machine เพื่อเดินทางย้อนเวลากลับไปและค้นหาวิธีแก้ปัญหาโดยใช้ D-mail เขารวบรวมทฤษฎีต่างๆ จากโลกต่างๆ ที่เขาเคยมีประสบการณ์เพื่อช่วยเพื่อนคนสำคัญของเขาและปกป้องพวกเขาจากการครอบงำโลกของ SERN