300 ปีผ่านไปนับตั้งแต่สงครามภัยพิบัติ การต่อสู้ครั้งยิ่งใหญ่ระหว่างโลกและดาวอังคาร คอร์เดเลีย สตรีผู้หนึ่งได้เดินทางไปยังโลกและสวมคุณธรรมแห่งอิสรภาพในเมืองคริสซีแห่งดาวอังคาร ซึ่งเป็นเกาะในทะเลอีเจียนที่ตั้งชื่อตามบุคคลในเทพนิยายกรีก ปัจจุบันเมืองนี้อยู่ภายใต้การควบคุมของรัฐบาลโลก มาพร้อมกับบอดี้การ์ดของบริษัทรักษาความปลอดภัย CGS Mikazuki Augus และ Orga Itsuka ทั้งสามคนถูกโจมตีโดยกลุ่ม Gjallarhorn ออร์กามองว่านี่เป็นโอกาสในการโค่นล้ม CGS และทำรัฐประหาร ผลก็คือมิคาซึกิและออร์กาต้องพัวพันกับความขัดแย้งครั้งใหม่ มิคาซึกิขับโมบิลสูทโบราณจากสงครามภัยพิบัติซึ่งขับเคลื่อนด้วยเครื่องปฏิกรณ์นิวเคลียร์เพื่อขับไล่กยาลลาร์ฮอร์น