ในที่สุดความสงบก็กลับคืนมาหลังจากการล่มสลายครั้งสุดท้ายของจอมโจรบาคุกันนากา Vestroia ถูกสร้างขึ้นใหม่ด้วยความพยายามของ Danma Kuusou, คู่หูของเขา Pyrus Dragonoid, Battle Brawlers คนอื่นๆ และความสำเร็จในการรวม Infinity และ Silent Cores เข้าด้วยกัน

น่าเสียดายที่โลกของ New Vestroia จะไม่ได้รับการผ่อนปรนใดๆ เนื่องจากถูกครอบงำโดยกลุ่ม Vestals ซึ่งเป็นกลุ่มผู้รุกรานจากนอกโลกที่เข้ายึดครองอย่างสบายๆ ผู้กดขี่เหล่านี้สามารถเข้าถึงอาวุธที่น่าสะพรึงกลัวซึ่งสามารถดักจับบาคุกันให้กลายเป็นลูกบอลได้ และจุดประสงค์ของพวกเขาคือการปราบเผ่าพันธุ์เพื่อความบันเทิงของพวกเขาเท่านั้น

สิ่งกีดขวางเพียงอย่างเดียวที่ขัดขวางเป้าหมายสูงสุดของพวกเขาคือการต่อต้าน Bakugan Battle Brawlers ซึ่งประกอบด้วยบาคุกันของมนุษย์และเวสตัลที่ต่อต้านแนวคิดในการกำจัดสายพันธุ์ที่มีความรู้สึก ภายใต้การนำของ Danma พวกเขาต้องเผชิญกับภารกิจที่น่ากลัวในการเข้าสู่ New Vestroia ซึ่งอยู่ภายใต้การควบคุมของศัตรู และต่อต้านการรุกรานของมนุษย์เพื่อรักษาความอยู่รอดของโลกโดยรวม