เนื้อเรื่องของ Sengoku Collection มีศูนย์กลางอยู่ที่กลุ่มซามูไรที่ถูกลบออกจากจักรวาลคู่ขนานที่มีบุคคลสำคัญทางประวัติศาสตร์ที่มีชื่อเสียง อย่างไรก็ตาม ในโลกนี้ ผู้อยู่อาศัยแต่ละคนถูกวาดภาพให้เป็นเด็กสาวมัธยมปลาย ซึ่งห่างไกลจากสงครามประวัติศาสตร์ที่พวกเขาเคยต่อสู้กัน เด็กผู้หญิงเหล่านี้มาจากยุคกลาง ต้องประหลาดใจกับสิ่งมหัศจรรย์สมัยใหม่ที่พวกเขาได้เห็นในโตเกียว พวกเขาผูกพันและเป็นเพื่อนสนิทกันผ่านประสบการณ์และการผจญภัยที่แบ่งปันกัน