เรื่องราวจะติดตามการเดินทางของตัวเอก Satoshi ในขณะที่เขาเริ่มต้นภารกิจเพื่อเป็น Pokémon Master ผ่านการฝึกฝนและการสำรวจ พวกเขาเดินทางร่วมกับสหายกลุ่มเล็กๆ ท่องไปในโลกที่เต็มไปด้วยโปเกมอนหลากหลายสายพันธุ์ เรื่องราวเริ่มต้นในวันแรกของซาโตชิในฐานะเทรนเนอร์โปเกมอน โดยเขาได้รับของขวัญเป็นโปเกมอนคู่หู พิคาชู ซึ่งตรงกันข้ามกับการเลือกของผู้เล่นในเกมฟูชิกิดาเนะ ฮิโตคาเงะ และเซนิกาเมะ ซีรีส์นี้ติดตามเนื้อเรื่องของเกมโปเกมอนอย่างใกล้ชิด