หลังจากพ่ายแพ้ต่ออัตตาที่เปลี่ยนแปลงไปของยูกิเมื่อหลายศตวรรษก่อน ผู้ร้ายชาวอียิปต์โบราณที่รู้จักกันในชื่ออานูบิสกลับฟื้นคืนชีพด้วยความปรารถนาอันแรงกล้าที่จะแก้แค้นเขา เมื่อสวมใส่สิ่งของชิ้นที่แปดแห่งสหัสวรรษ Anubis มีความมุ่งมั่นในภารกิจของเขาที่จะกำจัดยูกิและพิชิตโลก