เรื่องราวดำเนินไปประมาณปี พ.ศ. พ.ศ. 2558 ซึ่งเป็นช่วงเวลาที่ยุคแห่งเวทมนตร์สิ้นสุดลง "คาร์เดีย" เป็นกลุ่มรักษาสันติภาพที่มีวัตถุประสงค์เพื่อรักษาสมดุลของโลก ผ่านเหตุการณ์ "สงครามจอกศักดิ์สิทธิ์" ที่เกิดขึ้นในเมืองฟุยูกิ ประเทศญี่ปุ่น (ดังที่ปรากฎใน Fate/Stay Night) พวกเขาสามารถตรวจจับการมีอยู่ของ "เวทมนตร์" และหลีกเลี่ยงภัยพิบัติจากสงครามหมอผี ปัจจุบัน องค์กรคาร์เดียได้รับมอบหมายให้ค้นหาสิ่งบ่งชี้ของจอกศักดิ์สิทธิ์ต่อไป