เคียน เด็กหนุ่มผู้ยอมรับความจืดชืดของโลกใบนี้ ได้พบกับ สึซึมิยะ ฮารุฮิ เด็กสาวผู้มีความต้องการตามหาเอเลี่ยนและผู้มีพลังพิเศษ จนนำไปสู่การก่อตั้ง "กองพล SOS" กลุ่มที่รวบรวมสมาชิกผู้โชคร้ายมาทำกิจกรรมสุดประหลาดตามใจชอบของเธอ