Buddy Complex เป็นเรื่องราวของชายหนุ่มสองคนที่สร้างมิตรภาพที่ไม่น่าเป็นไปได้ เรื่องราวเริ่มต้นจาก Aoba Watasa เด็กธรรมดาที่ใช้ชีวิตเรียบง่ายในโตเกียว อย่างไรก็ตาม ในเช้าวันหนึ่งแห่งโชคชะตา ขณะเดินทางไปโรงเรียนเพื่อเริ่มภาคเรียนใหม่ อาโอบะได้พบกับจุนยู ดิโอ ไวน์เบิร์ก การเผชิญหน้ากับ Jyunyou ครั้งนี้ถือเป็นจุดเปลี่ยนในชีวิตของ Aoba เมื่อเด็กชายทั้งสองเริ่มต้นการเดินทางที่จะส่งผลที่ตามมาในวงกว้างต่อคนทั้งโลก