แอพแพร่หลายบนสมาร์ทโฟนทั่วโลก แต่หลายคนไม่ทราบว่ามีเอนทิตีที่เป็นความลับที่เรียกว่า Appli Monster หรือ Appmon สิ่งมีชีวิตปัญญาประดิษฐ์นี้อาศัยอยู่ในอาณาจักรที่อยู่ระหว่างโลกมนุษย์และมิติดิจิมอน Leviathan ซึ่งเป็นหัวหน้าของ Appmon ครอบงำพวกเขาผ่านไวรัสและการแฮ็กระบบโดยมีจุดประสงค์เพื่อควบคุมเผ่าพันธุ์มนุษย์ ชินไค ฮารุซึ่งติดตั้ง Appli Drive และ Gatchmon ต่อสู้กับคู่อริเพื่อพยายามคว้าชัยชนะ