ในวัน "ไทจู" นักเรียนมัธยมปลายคนหนึ่งตัดสินใจสารภาพรักกับเพื่อนร่วมชั้นที่เขาแอบชื่นชมมานานหลายปี ทันใดนั้น แสงแปลกๆ ก็ส่องสว่างไปทั่วโลก และในพริบตาเดียว ก็ทำให้ผู้คนกลายเป็นหิน ไทจูยังคงถูกแช่แข็งอยู่ในหิน ด้วยความปรารถนาอันไม่สมหวังมานานนับพันปี ในที่สุด ก้อนหินรอบตัวเขาก็แตกกระจาย เผยให้เห็นข้อความที่สั่งให้เขาเดินไปตามเส้นทางที่เฉพาะเจาะจง ตามเส้นทางนำ Taiju ไปสู่จุดหมายปลายทางที่เขาต้องการ ซึ่งเขาได้พบกับ Senku เพื่อนร่วมชั้นของเขาที่ตื่นขึ้นมาเมื่อหกเดือนก่อน Taiju ตัดสินใจร่วมมือกับ Senku และทำงานร่วมกันเพื่อเริ่มสร้างอารยธรรมมนุษย์ขึ้นมาใหม่ตั้งแต่เริ่มต้น