ตัวตนที่ไม่ปรากฏชื่อกำลังทำสงครามกับดินแดนของมนุษย์ วิธีการโจมตีเกี่ยวข้องกับหนามพิษซึ่งทำให้มนุษย์หมดสติ ผู้พิทักษ์เพียงคนเดียวที่เหลือเพื่อขัดขวางศัตรูนี้คือ Agumon, Gaomon และ Lalamon Rhythm ผู้นำของพวกเขาคือเด็กสาวที่พวกเขาช่วยพวกเขาให้พ้นจากภยันตราย ด้วยการนำทางของเธอ พวกเขาค้นพบว่าศัตรูของพวกเขาใช้ชื่ออาร์โกมอน แต่คำถามยังคงอยู่: ดิจิมอนทั้งสามตัวนี้จะทำอะไรได้บ้างเมื่อดูเหมือนจะไม่มีวิธีแก้ปัญหาที่เป็นไปได้ในสายตา?