บนเกาะฮัทสึจิมะซึ่งมีต้นซากุระบานตลอดทั้งปี มีต้นไม้ต้นหนึ่งที่ดูเหมือนจะแก่ที่สุดในจำนวนทั้งหมด เชื่อกันว่าใครก็ตามที่ขอพรใต้ต้นซากุระนี้สามารถขอพรได้ พี่น้องอาซาคุระ จุนอิจิและเนมุที่ไม่มีสายเลือดเดียวกันมุ่งหน้าสู่โรงเรียนวันแรก แต่ความรักที่พวกเขามีต่อกันนั้นแข็งแกร่งราวกับมีความสัมพันธ์กันทางสายเลือด นี่เป็นความลับที่น้อยคนนักจะรู้ เรื่องราวเริ่มต้นขึ้นเมื่อโยชิโนะ ซากุระ เพื่อนบ้านสมัยเด็กของพี่น้องอาซากุระกลับมาญี่ปุ่นหลังจากใช้เวลาหกปีในอเมริกาในฐานะนักเรียนแลกเปลี่ยน ทุกคนต้องประหลาดใจเมื่อซากุระไม่เปลี่ยนไปเลยตั้งแต่เธอจากไป การกลับมาของเธอคือการทำตามสัญญาที่เธอให้ไว้กับจุนอิจิเมื่อหกปีก่อนใต้ต้นซากุระต้นนั้น