เรื่องราวโดยย่อเกิดขึ้นที่เมืองเอโดะ ซึ่งปัจจุบันรู้จักกันในชื่อโตเกียว ในสมัยเอโดะ ในยุคนี้ สิ่งมีชีวิตนอกโลกที่เรียกว่า Celestials มายังโลกเพื่อตั้งอาณานิคมในโลกมนุษย์ เหล่าเซเลสเชียลสั่งริบยศและยศฐาบรรดาศักดิ์ของซามูไร และยึดดาบของตนออกไป ส่งผลให้การครองราชย์ของซามูไรสิ้นสุดลงอย่างมีประสิทธิภาพ ผลก็คือพวกเซเลสเชียลมีอำนาจมากขึ้นในเอโดะ อย่างไรก็ตาม มีบุคคลหนึ่งที่ยังคงมีจิตวิญญาณของซามูไรอยู่: ซากาตะ กินโทกิ อดีตนักรบซามูไรที่ต่อสู้กับเหล่าเซเลสเชียล ตอนนี้เขาเปิดร้านที่ขายสินค้าต่างๆ โดยมีผู้ช่วยของเขา ชิมูระ ชินปาจิ ชายหนุ่มที่สวมแว่นตาและกำลังเรียนรู้วิถีแห่งซามูไร และคากุระ เด็กสาวจากตระกูลยาโตะแห่งสวรรค์ ทั้งสามคนทำงานต่ำต้อยเพื่อจ่ายค่าเช่าและหาเงินเลี้ยงชีพในช่วง "ยุคมืด" ของซามูไร