ในปี 2045 โลกถูกบุกรุกโดย Irotsu ซึ่งมักมุ่งเป้าไปที่นักเรียนหญิงที่ไม่มีการป้องกัน โรงเรียนชินจุคามิเนะและโรงเรียนสตรีคานาเดโนะมิยะคือหนึ่งในเป้าหมายหลักของพวกเขา โฮชิโมริ (สตาร์การ์เดี้ยน) ก่อตั้งขึ้นเพื่อต่อต้านผู้รุกรานเหล่านี้ เนื่องจากนักเรียนหญิงขาดอาวุธและกลไกในการป้องกันตัวเอง