ในโลกของ God Eater มนุษยชาติถูกพระเจ้าทอดทิ้งและถูกทิ้งให้ถูกทำลายล้างโดยสิ่งมีชีวิตขนาดมหึมาที่รู้จักกันในชื่อ Aragami เพื่อความอยู่รอด มนุษย์จะต้องจับอาวุธและใช้อาวุธที่สามารถใช้พลังแห่งสวรรค์ได้ เรื่องราวเกิดขึ้นในญี่ปุ่นในช่วงปี 2071 ซึ่งองค์กร Fenrir มุ่งมั่นที่จะเอาชนะ Aragami และกอบกู้สิ่งที่เหลืออยู่ในโลก God Arc เป็นอาวุธที่สร้างขึ้นจากเซลล์ของ Aragami และผู้ที่สามารถใช้มันได้จะเรียกว่า God Eaters อาวุธเหล่านี้มีสองรูปแบบ: ดาบและปืน อย่างไรก็ตาม มีการค้นพบอาวุธประเภทใหม่ซึ่งสามารถสลับระหว่างสองรูปแบบและเพิ่มความคล่องตัวในสนามรบได้มากขึ้น