เมื่อได้รับคำเชิญจากเทรนเนอร์ผู้ลึกลับ ซาโตชิ คาซึมิ และทาเคชิได้พบกับมิวทู โปเกมอนมหัศจรรย์ที่ออกแบบมาเพื่อทดสอบความสามารถของพวกเขา