เรื่องราวของสคูบี้-ดูเป็นเรื่องเกี่ยวกับวัยรุ่นสี่คน ได้แก่ เฟร็ด ดาฟเน่ เวลมา และแชกกี้ ที่มาพร้อมกับสคูบี้-ดู เพื่อนสุนัขตัวใหญ่ที่กังวลแต่ตัวใหญ่ของพวกเขา วิธีการเดินทางของพวกเขาคือรถตู้สีสันสดใสที่เรียกว่าเครื่องลึกลับ (หรือที่เรียกว่า "เครื่องลึกลับ" ในประเทศของเรา) พวกเขาร่วมมือกันไขปริศนามากมาย ซึ่งมักเกิดขึ้นภายในที่อยู่อาศัยอันน่าขนลุกหรือเกี่ยวข้องกับเหตุการณ์เหนือธรรมชาติ อย่างไรก็ตาม ในที่สุดก็มีการเปิดเผยว่าปรากฏการณ์ที่ทำให้ไม่สงบเหล่านี้เป็นผลมาจากการกระทำของมนุษย์ ที่น่าสังเกตคือกลุ่มสามารถจับกุมผู้กระทำผิดได้สำเร็จ