ในอาณาจักรของ Duel Monsters นักดวลหน้าใหม่ต่างตั้งตารอโอกาสที่จะแข่งขันเพื่อตำแหน่งสูงสุด: King of the Games หนึ่งในนั้นคือ Juudai Yuuki ผู้ทะเยอทะยาน ผู้โชคดีที่ได้ลงทะเบียนเรียนที่ Duel Academy อันทรงเกียรติ สถาบันแห่งนี้มีหน้าที่รับผิดชอบในการติดตามและฝึกอบรมผู้มีโอกาสเป็นผู้ท้าชิงบัลลังก์รุ่นใหม่

ในช่วงวันแรกของ Juudai ท่าทางที่ไม่เมินเฉยและไร้กังวลของเขาส่งผลให้การสอบเข้าล่าช้า ณ สถานที่แห่งนี้ Juudai ได้พบกับบุคคลที่เป็นที่รู้จักซึ่งมอบ "Winged Kuriboh" ให้กับเขา ผู้พิทักษ์ซึ่งต่อมากลายเป็นสหายใหม่ของ Juudai ต่อจากนั้น Juudai เริ่มต้นการดำรงอยู่ของเขาในฐานะนักต่อสู้ อย่างไรก็ตาม คำถามยังคงอยู่: พลังแห่งโชคชะตาและความมุ่งร้ายจะเปลี่ยนความเป็นจริงของเขาให้กลายเป็นสิ่งที่เกินจินตนาการของเขาหรือไม่?

อินยู☆กิ☆โอ้! : Duel Monsters GX เรื่องราวจะติดตามการเดินทางของ Juudai ในขณะที่เขาไล่ตามความปรารถนาของเขาในการครองตำแหน่งราชาองค์ใหม่ของเกมนี้ ผ่านสถานการณ์ที่ไม่คาดคิดมากมาย Juudai และสหายของเขาถูกควบคุมตลอดเวลาและรับประกันว่าจะไม่พบกับช่วงเวลาที่น่าเบื่อแม้แต่ครั้งเดียวที่ Duel Academy