ไม่นานหลังจากเหตุการณ์ในภาคแรก แม้ว่าฉันจะเชื่อว่าฉันไม่สามารถทำหน้าที่ Pretty Cure ได้อีกต่อไป แต่ Mapple และ Mipple ก็ฟื้นคืนสติได้ มันเป็นช่วงเวลาแห่งความยากลำบากอย่างมากสำหรับนางิสะและโฮโนกะ เป็นอีกครั้งที่นักรบในตำนาน พริตตี้เคียว ได้เกิดใหม่อีกครั้ง ซึ่งบัดนี้มีพลังที่มากยิ่งขึ้นกว่าเดิม ในทางกลับกัน Jak King รวบรวมพลังสุดท้ายของเขาและโจมตีราชินีแห่งแสง สิ่งนี้ส่งผลให้ความตั้งใจสามประการของพระราชินีที่เรียกว่า "หัวใจแห่งชีวิตและหัวใจทั้งสิบสองดวง" ถูกแยกออกจากกันและกระจัดกระจายไปทั่วสวนสายรุ้ง ตอนนี้เป็นความรับผิดชอบของ Pretty Cure ในการค้นหาองค์ประกอบทั้งสามนี้และฟื้นฟูราชินีให้กลับสู่สภาพปกติอย่างรวดเร็วก่อนที่ Jar King จะฟื้นคืนชีพอีกครั้ง