หลังสงครามจอกศักดิ์สิทธิ์ครั้งที่ 4 Waver Velvet เข้ามารับหน้าที่เป็นหัวหน้าแผนกทฤษฎีเวทมนตร์สมัยใหม่ที่หอนาฬิกา สืบทอดต่อจาก Lord El-Melloi II เวฟเวอร์เดินทางร่วมกับเกรย์เด็กฝึกงานของเขาเพื่อค้นพบเงาลึกลับที่ไล่ตามพวกเขา อย่างไรก็ตาม นักเวทย์ของกิลด์ต้องเผชิญกับปัญหาที่อาจขัดขวางภารกิจของพวกเขา