ขณะที่ดวงอาทิตย์ยามเช้าทะลุผ่านเมฆหลังจากพายุฝนที่ไม่สามารถระบุได้ เด็กชายคนหนึ่งชื่อมูซาชิก็สะดุดเข้ากับร่างที่มีแสงสูงตระหง่านซึ่งสูญเสียพลังงานอย่างรุนแรง นี่เป็นการเผชิญหน้าครั้งแรกระหว่างมูซาชิและอุลตร้าแมนคอสมอส และมูซาชิช่วยเขาในการฟื้นฟูความแข็งแกร่งของเขา เพื่อเป็นการแสดงความขอบคุณ อุลตร้าแมนคอสมอสได้มอบหินสีน้ำเงินให้กับเขา ซึ่งแสดงถึงสถานะของเขาในฐานะ "ฮีโร่ที่แท้จริง" อย่างไรก็ตาม ปฏิสัมพันธ์ของพวกเขาถูกตัดให้สั้นลง เมื่อสิ่งมีชีวิตประหลาดปรากฏตัวขึ้น เมื่ออุลตร้าแมนคอสมอสเชื่อมั่นในตัวมูซาชิที่จะธำรงไว้ซึ่งความกล้าหาญ เด็กชายจะทำอย่างไรเพื่อตอบสนองต่อภัยคุกคามครั้งใหม่นี้