เมื่อตราผนึกแห่งภพปีศาจแตกสลาย ทหารปีศาจหลั่งไหลเข้าสู่โลกมนุษย์ ทำลายล้างทุกสิ่งในเส้นทาง นักรบหนุ่มทั้งห้าลุกขึ้นเผชิญหน้ากับการรุกราน เรียกชุดเกราะในตำนานออกมาและพุ่งเข้าสู่สมรภูมิ ทุกการปะทะ พวกเขาฟาดฟันฝ่ากองทัพปีศาจ ปลดปล่อยพลังเพื่อผลักดันการรุกรานกลับไป พวกเขาคือ...ซามูไรทรูปเปอร์ส!

ในพาร์ทที่สอง สามเดือนผ่านไปหลังจากการต่อสู้ครั้งใหญ่กับรามากะ ทรูปเปอร์สที่เหลืออยู่กำลังทำงานฟื้นฟูทุกสิ่งที่ถูกทำลาย และยังคงใคร่ครวญถึงเหตุการณ์ที่ผ่านมา แต่ภัยคุกคามใหม่กำลังก่อตัว และศัตรูที่แข็งแกร่งกว่าเดิมกำลังจะปรากฏ