บัตรโดยสารรถไฟ Denliner ซึ่งอำนวยความสะดวกในการเดินทางข้ามเวลาถูกขโมย เป็นผลให้ Nogami Ryotaro (หรือที่รู้จักกันในชื่อ Kamen Rider Denoh) และผู้โดยสารคนอื่นๆ บนรถไฟ รวมถึง Momotaro, Urataros, Kintaros, Ryutaros, Naomi Kohana, เจ้าของ และ Suzuki ล้วนมีส่วนร่วมในการสืบสวนคดีนี้ ในขณะเดียวกัน Nekataros ผู้ร้ายตัวจริงได้กลายร่างเป็น Nega Den-o ซึ่งอยู่ในร่างของ Den-o Megazord ในรูปแกะ เนกาทารอสร่วมมือกับคุโรกิ ผู้ต้องสงสัยที่ตำรวจพยายามตามหา ทั้งสองกำลังสร้างองค์กรชั่วร้ายซึ่งหากประสบความสำเร็จก็จะทำให้เกิดความสับสนวุ่นวายทุกแห่ง องค์กรได้คัดเลือกซากุระอิ ยูโตะ (หรือที่รู้จักกันในชื่อคาเมนไรเดอร์เซโรโนส) และเดเนบ แต่บทบาทที่แท้จริงของพวกเขาภายในองค์กรยังไม่ชัดเจน คุเรไน วาตารุ (คาเมนไรเดอร์ คิบะ) ต้องก้าวออกจากแถวเพื่อช่วยผนึกกำลังเพื่อหยุดยั้งเหล่าวายร้ายก่อนที่จะสายเกินไป